El  municipio de Aquitania se  divide en 16 veredas  que ocupan una extensión de 913.17 km2, es decir el 96.8%, un 3% corresponde al Lago de Tota, cuya extensión es de 28.92 km2, y el casco urbano cuya extensión corresponde a  95.8 hectáreas ocupando solo el 1% de la extensión territorial total.